本校為積極培養環境教育、環境保護及生態保育人才，由本中心協助於民國八十二年成立國內首座的環境教育研究所。此後，為配合教育部「教育行政機關及所屬各級學校暨附屬機構環境保護小組設置要點」、行政院「勞工安全衛生法」與本校組織章程，本校陸續設置環境保護小組、勞工安全衛生小組、學校衛生委員會，以分工合作辦理本校安全衛生與校園環境管理之相關事宜。

　　依教育部（1997）建議大學、獨立學院及專科學校環境保護小組組織與主要工作架構，本校環境保護小組為協調指導學校環保相關工作之單位。本中心負責環教推廣活動、出版刊物與教學媒體、提供環教諮詢服務、規劃辦理環教計畫等工作。環境教育研究所，負責環境教育學術研究及行政人才之培訓，以及環教學術理論及推動策略研究等工作。勞工安全衛生委員會，負責實驗室安全管理、廢污處理與減量等校園安全與污染防治工作。學校衛生委員會，負責校園環境衛生之維護與管理。此外，有關資源回收與利用、水電節省、校園綠美化等校園環保工作之策劃與推動，則由總務處統籌辦理。

　　依據本校環境教育中心設置辦法，本中心設置主任一人，首任主任（78年－83年）由本校前校長梁尚勇教授敦聘前教務長楊冠政教授兼任；八十四年度起迄今，主任由呂溪木校長聘請本校環境教育所汪靜明教授兼任，負責綜理中心業務之推展，並協助本校環境教育研究所之學術研究與教學工作。

　　為辦理各項環境教育相關事宜，本中心原設有學校環境教育、社會環境教育、資料出版與綜合業務等四組。八十七年起，依發展現況需要，改設綜合業務、推廣服務與資料出版組等三組（業經本校87.11.07師大人字第06954號函備文教育部）。各組可分別設置組長一人，由主任自本校教育學院地理系、衛教系，及理學院生物系等院系教授，簽請校長核聘兼任之。自八十七年度起，依據行政院政府組織再造及本校組織章程修訂，本中心已配合進行人事精簡，以符合自給自足之原則，並發揮最大功能推動環境教育。目前學校核定本中心編制助理研究員一人，主要負責公文簽收及財產管理之行政事宜。

　　此外，本中心推動之環境保育及教育工作，主要係由政府與民間委請歷任中心主任主持之專案計畫推廣之。在人力資源方面，則由專案計畫助理、顧問及主任所指導之環教所研究生協助調配執行。